六珍船只掉队问题直接影响战斗效率和资源获取。船只掉队通常由航行路径规划不当、潮汐变化应对不足或团队协作缺失导致。静待涨潮是利用潮水摆脱搁浅的有效方法，这种方法能保证船只安全且节省人力物力。当船只因意外情况脱离编队时，直接前往下一站与船队汇合是最优解，避免盲目追赶消耗额外资源。
航行前必须充分掌握海域潮汐规律与地形特征。游戏内潮汐系统具有周期性，涨潮时水位上升可自然解除搁浅状态。若遭遇鲨鱼群围困或海盗袭击，需针对性选择应对方案：面对鲨鱼群应保持队形缓慢通过，遭遇海盗则需准备火箭实施火攻。海域突发事件处理能力直接影响船队整体行进效率，指挥官需提前制定应急预案。
船只属性配置是防止掉队的技术基础。黑珍珠等特殊船只的射速、航速属性需通过图纸改造提升，紫色以上图纸可将黑珍珠航速上限提升至55%-75%。战斗用船只与商用船只应分开配置，商用船优先保证货仓容量与航速。锁定石的使用能固定优质属性，需注意船只出售后锁定石会自动返还，不必过度节省该资源。
团队协作机制是维持船队完整的关键。通过联盟系统保持实时通讯，遭遇狂风骤雨等天气突变时，全体船只应收起风帆停航等待。当部分水手出现坏血病症状，及时发放豆芽补充维生素。指挥官需合理分配侦查船、指挥船、救护船等职能单位，采用旗语、号角、信号灯等多重通讯手段维持队形。
